肠道菌(jun)群在人(ren)体代谢性(xing)疾病中(zhong)扮演着(zhe)重要(yao)角色,甚至被(bei)称为“人(ren)类的第(di)二大脑”。近年来,越(yue)来越(yue)多(duo)(duo)的肠道菌群相关(guan)项目得到了国家(jia)自然基金资助,同时也涌(yong)现了许多(duo)(duo)探究肠道(dao)菌(jun)群深层(ceng)机(ji)制的(de)高分优秀(xiu)文章。
但由于肠道菌群的构成非常(chang)复杂,因此一直缺乏(fa)对功能性分子或小分子代谢物的相关研(yan)究。那(nei)么,该(gai)从哪方(fang)面切(qie)入去开展(zhan)研究,才能兼备创新性和实用性呢?和(he)小编(bian)一(yi)起来看看这篇(pian)文(wen)章吧!
近日(ri),北京大学医学部姜长(zhang)涛教授联合北京(jing)大学第三(san)医院乔杰院士、化学(xue)学(xue)院雷晓光(guang)教(jiao)授等多(duo)研(yan)究团队在Science杂(za)志发表了研究成(cheng)果[1],首次提出了肠道菌源宿主同工酶新概念,发现:菌源宿主同工酶在肠道中广泛存在,能够模拟宿主酶的功能,参与疾病的发生发展;此外,还发现了首个对菌源DPP4具有高活性和强选择性的小分子抑制剂Dau-d4,可通过特异(yi)性(xing)抑制菌源DPP4,改善糖耐量异(yi)常,为靶向肠道菌群的代谢性(xing)疾(ji)病的精准化治疗带来新突破。
一、研(yan)究内(nei)容(rong)与(yu)思路(lu)
1、微生物(wu)-宿(su)主同工酶的功(gong)能筛(shai)选(xuan)
研究(jiu)者(zhe)建立(li)了一个筛选(xuan)平台来鉴(jian)定可能(neng)影响宿(su)(su)主(zhu)功能(neng)的(de)微生物-宿(su)(su)主(zhu)同工酶(mei)(mei)(mei),收集了3名(ming)健康志愿(yuan)者(zhe)的(de)新(xin)鲜粪便(bian)样本以及小鼠的(de)新(xin)鲜粪便(bian)样本,对110种在(zai)各种人类疾病(bing)中(zhong)起作用的(de)酶(mei)(mei)(mei)进行了筛选(xuan)。利用该系统,研究(jiu)者(zhe)发现71种酶(mei)(mei)(mei)在(zai)肠(chang)道(dao)菌群中(zhong)存(cun)(cun)在(zai)同工酶(mei)(mei)(mei),而这(zhei)些酶(mei)(mei)(mei)种类多(duo)样、功能(neng)全面,提(ti)示菌源宿(su)(su)主(zhu)同工酶(mei)(mei)(mei)在(zai)肠(chang)道(dao)中(zhong)广(guang)泛存(cun)(cun)在(zai),可能(neng)有效模拟宿(su)(su)主(zhu)酶(mei)(mei)(mei)的(de)功能(neng)。
在所有的人(ren)类样(yang)本中,菌源(yuan)宿主同工酶活性最高的是(shi)DPP4。此外,饲养在普通环境的(de)小(xiao)(xiao)鼠粪便(bian)中,DPP4活性显著高于无菌小(xiao)(xiao)鼠。DPP4是(shi)一个(ge)常用的(de)2型糖尿病治(zhi)疗靶点,肠道DPP4是(shi)降解(jie)GLP-1调节(jie)葡萄糖耐量(liang)所必需的(de)。
基(ji)于上述理(li)论(lun)基(ji)础,研究(jiu)者给(ji)予(yu)无菌(jun)小(xiao)鼠(shu)广谱抗生(sheng)素灌胃处理(li)。结(jie)果发现,小(xiao)鼠(shu)肠(chang)外组织和(he)血(xue)浆(jiang)的GLP-1活性(xing)(xing)和(he)总水平(ping)却没有变化。但当(dang)给(ji)小(xiao)鼠(shu)喂食(shi)HFD且增加了肠(chang)道屏障通透性(xing)(xing)或(huo)给(ji)予(yu)低浓度葡(pu)聚糖硫酸钠(DSS)或吲哚(duo)美辛增(zeng)(zeng)加(jia)肠通透性(xing)后,发现可见DPP4活性(xing)增(zeng)(zeng)加(jia)和GLP-1活性(xing)降低,糖耐(nai)量(liang)异常(chang)。
研究思路:研(yan)究者(zhe)构建了一个新的筛选平台,在人类以及小鼠新鲜(xian)粪便(bian)样本(ben)发现了菌源宿主同工酶的存在,并以最活跃的DPP4为研(yan)究对象开展后(hou)(hou)续研(yan)究。首先,研(yan)究者(zhe)探索了“在什么情况下会(hui)影(ying)响肠道(dao)DPP4以及GLP-1”,以便(bian)开展后(hou)(hou)续实(shi)验。
2、产生DPP4的(de)细(xi)菌的(de)鉴(jian)定
进一步,研究者鉴定了DPP4的(de)微生物生产(chan)者。通过肠(chang)道共生菌(jun)株的(de)分离培养、DPP4活性检(jian)测,发现了多形拟(ni)杆菌(jun)、普通拟(ni)杆菌(jun)等(deng)多种拟(ni)杆菌(jun)属细菌(jun)均具有菌(jun)源(yuan)DPP4活性。同时,研究者还发现菌(jun)源(yuan)DPP4(btDPP4)对GLP-1活性最强,甚至高于人(ren)类DPP4(hDPP4)。
研究思路:明确了“在肠道屏障受损时DPP4会发生变化”后,研究者进一步定位了分泌DPP4影响肠道的具体(ti)菌(jun)群,为后续构建动物模型作铺垫。
3、微(wei)生物DPP4破坏(huai)宿(su)主葡萄糖稳(wen)态
研究者探究了DPP4在宿主葡萄糖代谢中的作用,采用CRISPR-Cas4系统并构建多种小鼠模型来过表达或沉默DPP4进行研究,给予HFD破坏了肠道屏障,最终发现:多形拟杆菌可以以btDPP4依赖的方式降低宿主活性GLP-1水平,诱导糖耐量异常。
研究(jiu)思(si)路(lu):第二(er)步研究(jiu)发(fa)现(xian)多(duo)形拟杆菌会分泌(mi)DPP4,加(jia)上已有相关研究(jiu)表明“DPP4是2型糖尿病(bing)的疾病(bing)治疗(liao)靶点(dian)之(zhi)一”,基(ji)于此,研究(jiu)者验证(zheng)了(le)在小鼠模型中,DPP4在葡萄糖代(dai)谢中发(fa)挥的作用,与第一步研究(jiu)相呼应,同时点(dian)明了(le)btDPP4的重要作用。
4、临床DPP4抑(yi)制(zhi)剂不抑(yi)制(zhi)微生物DPP4
研究者研究了DPP4抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)剂西(xi)(xi)(xi)格(ge)列汀(ting)是否可以抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)微生物(wu)(wu)DPP4,结(jie)(jie)果发现,西(xi)(xi)(xi)格(ge)列汀(ting)对(dui)btDPP4的(de)(de)抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)作用(yong)较弱。进(jin)一步(bu)分析发现,可能原因是btDPP4-西(xi)(xi)(xi)格(ge)列汀(ting)复合物(wu)(wu)结(jie)(jie)构存在弱TMTP接触导致的(de)(de),可变(bian)V/VI接头基序可能是西(xi)(xi)(xi)格(ge)列汀(ting)对(dui)不同DPP4抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)效果不同的(de)(de)结(jie)(jie)构基础。
研究者进一步开展了西格(ge)(ge)列(lie)汀(ting)临(lin)床(chuang)试(shi)验和(he)动物研究,采用多组学关联分(fen)析、菌(jun)群移植、噬(shi)菌(jun)体靶向干(gan)预等多项实验,发现多形拟杆菌(jun)产(chan)生的(de)btDPP4影响了西格(ge)(ge)列(lie)汀(ting)的(de)治疗效果(guo),解释了为什么西格(ge)(ge)列(lie)汀(ting)抑制效果(guo)因(yin)人而异。此外,还(hai)表明,后续需要(yao)抑制hDPP4和(he)btDPP4,以更有效地改(gai)善(shan)葡萄糖稳(wen)态。
研究(jiu)(jiu)思路:西格(ge)列(lie)(lie)(lie)汀是(shi)临床常用DPP4抑(yi)制剂,但(dan)疗效(xiao)因人而(er)异,原(yuan)因一直有待发掘。研究(jiu)(jiu)者探(tan)究(jiu)(jiu)了(le)西格(ge)列(lie)(lie)(lie)汀是(shi)否(fou)能(neng)影(ying)(ying)响(xiang)btDPP4,结果(guo)显示(shi)影(ying)(ying)响(xiang)较小,可能(neng)原(yuan)因是(shi):西格(ge)列(lie)(lie)(lie)汀只影(ying)(ying)响(xiang)了(le)hDPP4而(er)弱作(zuo)用btDPP4,导致治(zhi)疗效(xiao)果(guo)较差(cha)。这一步将科研与临床实(shi)际相结合(he),提出了(le)适(shi)合(he)的临床治(zhi)疗改进方案(an)。
5、Dau-d4是一种特异(yi)性btDPP4抑制剂
研究(jiu)者(zhe)建立了一种使用btDPP4蛋白(bai)的高通量(liang)(liang)药物(wu)筛选系(xi)统,通过对约107,000个(ge)小分(fen)子化合物(wu)的高通量(liang)(liang)筛选,发现了蝙蝠(fu)葛苏林碱(Dau)具有最强的btDPP4抑制活性,但对hDPP4没有抑制作用。
进一步的结构改造与活性评价显示,Dau的衍生物Dau-d4对菌群DPP4有着很强的抑制作用,还对hDPP4存在一定抑制作用,从而在不影响肠(chang)道共生菌的生长与组成(cheng)的情况下改善了糖代谢紊乱。
研究思路:既然提出了疑问,那就需要寻找适合的解决方法——研究者采用高通量药物筛选系统发现了Dau,通过验证其功能后发现存在一定的缺陷,因此后续在此基础上不断地挖掘,最终发现了衍生物Dau-d4。
6、Dau-d4改(gai)善葡萄糖稳(wen)态
接下来(lai),研究者探究了Dau-d4在(zai)小鼠(shu)(shu)中(zhong)的(de)具体治(zhi)疗(liao)效果,针对(dui)Dpp4-/-小鼠(shu)(shu)、ob/ob小鼠(shu)(shu)等多种动(dong)物模型给予HFD、DSS饮水等条件以(yi)及Dau-d4治(zhi)疗(liao),发现Dau-d4均可以(yi)通过抑制(zhi)(zhi)btDPP4,增加活性(xing)GLP-1,改(gai)善糖(tang)耐量异(yi)常,且不(bu)会(hui)对(dui)肠(chang)道(dao)菌群生(sheng)长产生(sheng)抑制(zhi)(zhi),也不(bu)存在(zai)肝(gan)肾(shen)毒性(xing)。除此之外(wai),Dau-d4与西(xi)格列汀(ting)联(lian)合治(zhi)疗(liao)还可以(yi)改(gai)善西(xi)格列汀(ting)单独治(zhi)疗(liao)带来(lai)的(de)副作用。
研(yan)究思(si)路:发现(xian)了抑制药物之后,接下来(lai)便是验证药物的疗效、安(an)全性以及与(yu)当前临床(chuang)治疗药物西格列汀的比较或联合治疗效果。
二(er)、小结
菌源DPP4可能(neng)是2型(xing)(xing)糖尿病的(de)治(zhi)疗靶点,而DPP4抑制(zhi)剂Dau-d4可以在(zai)不(bu)干扰菌群整体(ti)功能(neng)的(de)条(tiao)件下,特(te)异性靶向菌源DPP4,同时(shi)对人(ren)DPP4存在(zai)一定抑制(zhi)作用,有效改善(shan)代谢(xie)紊乱(luan),是潜在(zai)的(de)治(zhi)疗2型(xing)(xing)糖尿病的(de)新型(xing)(xing)药(yao)物(wu)。
该(gai)研(yan)究开发了一种鉴定(ding)未表(biao)征(zheng)的肠道微生物-宿主同工酶的(de)新(xin)策略,筛选(xuan)出(chu)活性最高的(de)主角DPP4,之后开(kai)展了一(yi)段“发现靶点--机制验证--药物筛选和疗效验证”的全链条研究体(ti)系,为开发新(xin)治(zhi)疗(liao)方法提(ti)供(gong)了可能(neng)。
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