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NC|上海科技大学免化所杨贝课题组与合作者揭示HIV-1流行重组亚型的Env蛋白结构与免疫识别特征

      近日(ri),上海科(ke)技大学(xue)免疫化学(xue)研(yan)究所(suo)杨贝课题(ti)组中国疾病预防控(kong)制(zhi)中心性病艾滋病预防控(kong)制(zhi)中心团队(dui)合作国际学术期刊(kan)《自然通讯》(Nature Communications)上(shang)发(fa)表(biao)题为“Structures and immune recognition of Env trimers from two Asia prevalent HIV-1 CRFs”的研(yan)究论文(wen),报道了我国HIV-1病(bing)毒(du)的主(zhu)流亚型(即流行重组亚型(xing)CRF01_AECRF07_BC)的Env蛋(dan)白结构与免疫识别特(te)征揭示(shi)了CRF01_AE亚型Env蛋白在V1区域(yu)的(de)独有特(te)征(zheng)及其与该(gai)亚型的(de)广(guang)谱(pu)中和抗体(ti)逃逸能力之间的关系(xi),并阐明了第一(yi)株分离自CRF01_AE感染个体的广谱(pu)中和抗体新型中和机制。该研究拓宽了(le)对于HIV-1行(xing)重组亚型的认识(shi),为(wei)后续针对我国主(zhu)流HIV-1亚型开(kai)展免(mian)疫(yi)聚焦型疫(yi)苗设计(ji)和相关广(guang)谱中(zhong)和(he)抗体的应用开(kai)发(fa)提供(gong)了理论依据。


人类免疫缺陷病毒I型(xing)(HIV-1是艾(ai)滋病(bing)流(liu)行的肇因。位于HIV-1病毒表面的Env蛋(dan)白(bai)三(san)聚体(ti)是(shi)介导病毒侵染宿主细胞的关键分(fen)子,也是(shi)病毒(du)颗粒表面唯一可(ke)被(bei)宿(su)主(zhu)免疫系统识别的(de)靶标,因而一直(zhi)是艾(ai)滋病疫苗研发的焦点。然而,HIV-1病毒(du)超(chao)高的基因组(zu)变异性赋予了Env蛋(dan)白(bai)高度的序列多样性,同时Env蛋白也具有丰富多(duo)变的(de)糖基化(hua)修(xiu)饰,这些因素(su)使得艾滋病疫苗的传统(tong)研发(fa)遭(zao)遇(yu)巨(ju)大(da)困难(nan)。近年来,研究人员从(cong)极少数HIV-1慢性感染(ran)人群(qun)中陆续分(fen)离获(huo)得了(le)一系列广谱中和(he)抗体(bNAbs),它们可以识(shi)别Env蛋白表面不容(rong)易发生变化的(de)功能(neng)性区域,从而对于不同的(de)HIV-1病毒株系(xi)均表(biao)现出优越的中和效力。广谱中(zhong)和抗体的发现为困顿中的艾滋病疫苗研发指引了新(xin)的方向,促使了结构指导的免疫聚焦型疫苗策(ce)略(lve)在艾滋病疫(yi)苗研发(fa)中的应用。该策略的核(he)心思想是通过结构指导的反向蛋白质工程设计,在(zai)屏蔽(bi)无效表(biao)位的同时将(jiang)广谱中和抗体的抗原表(biao)位特异性地呈递给宿主的(de)免疫系统,从而使宿主(zhu)免(mian)疫应(ying)答聚焦(jiao)在这(zhei)些(xie)保守的(de)免疫脆弱(ruo)点区域,进而引发(fa)有效和广的体(ti)液免疫反应来(lai)预(yu)防(fang)未(wei)来(lai)的感(gan)染(ran)。


免(mian)疫聚焦型疫苗策略的(de)开展不仅需要广谱中和抗体(ti)抗原表位的(de)指引(yin),也需要对(dui)Env蛋白的结构与抗原特征(zheng)进行全(quan)面掌握当前针对Env蛋白的结构与抗原特征研究(jiu)均集中于在欧、美非洲流行的(de)ABC亚型(xing),对于在亚洲尤其(qi)是我(wo)国占主导地位的流行重组(zu)型(xing)CRF01_AE和(he)CRF07_BC鲜有相(xiang)关报道。此外(wai),仅极(ji)少数广(guang)谱中和抗体从(cong)感(gan)染流行重(zhong)组(zu)个体中分离,且它们的抗原表位(wei)与中(zhong)和机制也尚未得到充分阐释。上述(shu)信息的(de)缺乏(fa)阻碍了们对于(yu)流行重组亚型Env蛋白的结构(gou)与免疫原性的认(ren)识(shi),也不利(li)于免疫聚焦型疫苗研发策略在我国的开展及应用在此背景(jing)下,杨贝课题组与合作(zuo)者开展(zhan)了深入的研究(jiu)。

研(yan)究团(tuan)队首(shou)先利用单分子冷冻电镜技术与生物大分子质谱全面揭示了CRF01_AECRF07_BC代表型(xing)株系的Env蛋白结构与糖基化(hua)修饰(shi)(图1a-c)。随后从上述(shu)研究中(zhong)获得的线(xian)索出发,对当(dang)前数(shu)据库中(zhong)六(liu)千余条不同亚型的Env蛋白(bai)的V1区域(yu)进行了跨亚型对比和分析。结果(guo)显示,相(xiang)比于其他(ta)亚(ya)型,CRF01_AE亚(ya)型的V1区(qu)域长度(du)显著增长(图1d),且糖基化(hua)修饰位点(dian)数目显著增多(图1e-f)。进一步对中(zhong)和实(shi)验数据V1区(qu)域特征(zheng)的关联分析显示CRF01_AE亚型V1区域的上述特征会明(ming)显削弱两(liang)类(lei)广谱中和抗体(ti)(分别靶向Env蛋白(bai)的apexV3区域)对CRF01_AE亚型的中和效果(图1g-h)。上(shang)述研(yan)究(jiu)结果提(ti)示,应(ying)尽量避免在CRF01_AE亚型的流行区域开展(zhan)靶向ApexV3区域的(de)免疫聚(ju)焦型疫苗或广谱中和抗体的(de)临床试验(yan)。

F6是第一株分离自CRF01_AE感染个体的广谱中和抗体。研究团队还通过高分辨率冷冻电镜结构解析揭示了F6Env蛋(dan)白上的详细抗原表位(图2a),并进(jin)一步通过(guo)结构分(fen)析与功(gong)能实(shi)验(yan)验证阐明F6新型中和机制(图2b:F6一方面通过变构效应扰动Env蛋白三(san)聚体(ti)Apex区域的稳定性,破坏(huai)Env蛋白(bai)与宿主CD4受体的结合,另一方面通过诱导三聚体的解体来阻碍Env蛋白介导的病毒包膜与细胞膜的融合,进而抑制病毒对于宿主的入(ru)侵(图2b


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